Temporomandibular eklem, temporal kemiğin mandibular fossasına uyan mandibula kondil başları tarafından oluşturulur. Çene ekleminin hareketi bir düzlemde menteşe hareketine izin verirken, aynı zamanda başka bir düzlemde kayma hareketine izin verdiğinden oldukça karmaşık bir yapıdır. Mandibula kondil başı ve temporal kemiğin temporal fossası arasında fibröz bağ dokusundan oluşan, diz eklemindeki menisküse benzeyen eklem diski mevcuttur.
Çene hareketi, ana çiğneme kasları olarak adlandırılan dört çift kas ile gerçekleştirilir: masseter, temporalis, medial pterigoid ve lateral pterigoid. Masseter, temporalis ve medial pterigoid kasları çeneyi kapatma hareketini, lateral pterigoid kaslar çeneyi açma hareketini sağlar.
Çene ekleminin patofizyolojisi tartışılırken, iki ana kategori göz önünde bulundurulmalıdır: eklem patofizyolojisi ve kas patofizyolojisi. Bu koşullar için etyolojik düşünceler ve tedavi stratejileri farklı olduğundan, ayrı tedavi seçenekleri sunulur.